Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RPL17P18621 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RPL17P18621 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RPL17P18621 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RPL17P18621 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RPL17P18621 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL17P18621 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL17P18621 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL17P18621 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL17P18621 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL17P18621 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RPL17P18621 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RPL17P18621 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL17P18621 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL17P18621 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL17P18621 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RPL17P18621 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RPL17P18621 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL17P18621 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL17P18621 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL17P18621 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL17P18621 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RPL17P18621 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL17P18621 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RPL17P18621 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL17P18621 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL17P18621 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RPL17P18621 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms