Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPI1P17947 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SPI1P17947 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
SPI1P17947 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPI1P17947 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPI1P17947 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPI1P17947 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPI1P17947 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPI1P17947 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPI1P17947 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPI1P17947 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPI1P17947 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPI1P17947 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPI1P17947 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPI1P17947 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPI1P17947 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPI1P17947 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPI1P17947 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPI1P17947 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SPI1P17947 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPI1P17947 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPI1P17947 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPI1P17947 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPI1P17947 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPI1P17947 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SPI1P17947 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPI1P17947 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPI1P17947 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPI1P17947 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPI1P17947 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SPI1P17947 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPI1P17947 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPI1P17947 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPI1P17947 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SPI1P17947 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SPI1P17947 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms