Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HOXB8P17481 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXB8P17481 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXB8P17481 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXB8P17481 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms