Protein–RNA interactions for Protein: P17302

GJA1, Gap junction alpha-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA1P17302 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GJA1P17302 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA1P17302 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
GJA1P17302 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA1P17302 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA1P17302 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA1P17302 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA1P17302 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GJA1P17302 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
GJA1P17302 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GJA1P17302 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GJA1P17302 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GJA1P17302 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA1P17302 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA1P17302 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA1P17302 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA1P17302 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA1P17302 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA1P17302 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA1P17302 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA1P17302 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GJA1P17302 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJA1P17302 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GJA1P17302 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA1P17302 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA1P17302 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA1P17302 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA1P17302 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA1P17302 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA1P17302 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GJA1P17302 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA1P17302 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA1P17302 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA1P17302 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA1P17302 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA1P17302 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA1P17302 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GJA1P17302 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GJA1P17302 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA1P17302 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GJA1P17302 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms