Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PDGFRAP16234 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PDGFRAP16234 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PDGFRAP16234 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms