Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD44P16070 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD44P16070 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD44P16070 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CD44P16070 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD44P16070 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CD44P16070 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CD44P16070 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CD44P16070 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD44P16070 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CD44P16070 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD44P16070 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD44P16070 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD44P16070 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CD44P16070 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD44P16070 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD44P16070 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD44P16070 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD44P16070 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD44P16070 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD44P16070 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CD44P16070 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CD44P16070 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD44P16070 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD44P16070 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD44P16070 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD44P16070 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD44P16070 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CD44P16070 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CD44P16070 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CD44P16070 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CD44P16070 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CD44P16070 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD44P16070 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD44P16070 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD44P16070 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CD44P16070 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CD44P16070 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CD44P16070 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD44P16070 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD44P16070 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD44P16070 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD44P16070 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD44P16070 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CD44P16070 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms