Protein–RNA interactions for Protein: P11277

SPTB, Spectrin beta chain, erythrocytic, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBP11277 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBP11277 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SPTBP11277 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SPTBP11277 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SPTBP11277 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SPTBP11277 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SPTBP11277 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SPTBP11277 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SPTBP11277 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBP11277 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBP11277 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBP11277 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBP11277 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBP11277 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBP11277 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPTBP11277 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPTBP11277 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPTBP11277 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms