Protein–RNA interactions for Protein: P10276

RARA, Retinoic acid receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARAP10276 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARAP10276 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARAP10276 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARAP10276 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RARAP10276 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
RARAP10276 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RARAP10276 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RARAP10276 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RARAP10276 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARAP10276 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARAP10276 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARAP10276 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARAP10276 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARAP10276 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARAP10276 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RARAP10276 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARAP10276 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARAP10276 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARAP10276 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARAP10276 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RARAP10276 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RARAP10276 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RARAP10276 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RARAP10276 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RARAP10276 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RARAP10276 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RARAP10276 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RARAP10276 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RARAP10276 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RARAP10276 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARAP10276 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARAP10276 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARAP10276 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARAP10276 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RARAP10276 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RARAP10276 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RARAP10276 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARAP10276 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARAP10276 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RARAP10276 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms