Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CCDC192P0DO97 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCDC192P0DO97 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CCDC192P0DO97 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms