Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
OPN1MW3P0DN78 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
OPN1MW3P0DN78 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms