Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW4

SMIM10L2A, Small integral membrane protein 10-like protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2AP0DMW4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SMIM10L2AP0DMW4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SMIM10L2AP0DMW4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SMIM10L2AP0DMW4 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms