Protein–RNA interactions for Protein: P0DJR0

GIMD1, GTPase IMAP family member GIMD1, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIMD1P0DJR0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
GIMD1P0DJR0 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GIMD1P0DJR0 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms