Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
RGPD2P0DJD1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
RGPD2P0DJD1 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
RGPD2P0DJD1 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms