Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TRIM49P0CI25 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TRIM49P0CI25 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
TRIM49P0CI25 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM49P0CI25 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 139.5 ms