Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L4

C4A, Complement C4-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4AP0C0L4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
C4AP0C0L4 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
C4AP0C0L4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
C4AP0C0L4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms