Protein–RNA interactions for Protein: P09493

TPM1, Tropomyosin alpha-1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM1P09493 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM1P09493 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TPM1P09493 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM1P09493 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM1P09493 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM1P09493 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM1P09493 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM1P09493 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TPM1P09493 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TPM1P09493 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM1P09493 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM1P09493 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM1P09493 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM1P09493 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM1P09493 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM1P09493 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TPM1P09493 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM1P09493 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM1P09493 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM1P09493 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM1P09493 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TPM1P09493 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TPM1P09493 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM1P09493 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM1P09493 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM1P09493 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM1P09493 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM1P09493 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM1P09493 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TPM1P09493 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM1P09493 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM1P09493 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM1P09493 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM1P09493 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TPM1P09493 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM1P09493 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM1P09493 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM1P09493 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM1P09493 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM1P09493 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TPM1P09493 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM1P09493 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM1P09493 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM1P09493 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM1P09493 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM1P09493 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM1P09493 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TPM1P09493 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM1P09493 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM1P09493 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM1P09493 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM1P09493 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM1P09493 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM1P09493 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TPM1P09493 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM1P09493 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM1P09493 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM1P09493 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM1P09493 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM1P09493 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM1P09493 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TPM1P09493 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM1P09493 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM1P09493 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM1P09493 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM1P09493 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TPM1P09493 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TPM1P09493 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TPM1P09493 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM1P09493 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM1P09493 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM1P09493 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM1P09493 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM1P09493 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM1P09493 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TPM1P09493 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TPM1P09493 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms