Protein–RNA interactions for Protein: P08865

RPSA, 40S ribosomal protein SA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP08865 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPSAP08865 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPSAP08865 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPSAP08865 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPSAP08865 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPSAP08865 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPSAP08865 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPSAP08865 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPSAP08865 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPSAP08865 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPSAP08865 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPSAP08865 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPSAP08865 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPSAP08865 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPSAP08865 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPSAP08865 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPSAP08865 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPSAP08865 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPSAP08865 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPSAP08865 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPSAP08865 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPSAP08865 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPSAP08865 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPSAP08865 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPSAP08865 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPSAP08865 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPSAP08865 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPSAP08865 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPSAP08865 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPSAP08865 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPSAP08865 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPSAP08865 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPSAP08865 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPSAP08865 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPSAP08865 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPSAP08865 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms