Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MYL1P05976 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL1P05976 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL1P05976 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL1P05976 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MYL1P05976 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYL1P05976 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYL1P05976 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYL1P05976 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYL1P05976 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
MYL1P05976 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL1P05976 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL1P05976 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL1P05976 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL1P05976 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MYL1P05976 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
MYL1P05976 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MYL1P05976 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
MYL1P05976 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL1P05976 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL1P05976 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL1P05976 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL1P05976 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL1P05976 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MYL1P05976 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL1P05976 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL1P05976 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL1P05976 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL1P05976 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL1P05976 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
MYL1P05976 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYL1P05976 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYL1P05976 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MYL1P05976 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
MYL1P05976 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL1P05976 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL1P05976 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL1P05976 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL1P05976 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL1P05976 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL1P05976 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MYL1P05976 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
MYL1P05976 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms