Protein–RNA interactions for Protein: P03999

OPN1SW, Short-wave-sensitive opsin 1, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1SWP03999 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
OPN1SWP03999 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
OPN1SWP03999 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
OPN1SWP03999 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms