Protein–RNA interactions for Protein: O95859

TSPAN12, Tetraspanin-12, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN12O95859 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSPAN12O95859 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSPAN12O95859 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms