Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KIF4AO95239 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
KIF4AO95239 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms