Protein–RNA interactions for Protein: O94788

ALDH1A2, Retinal dehydrogenase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH1A2O94788 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ALDH1A2O94788 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ALDH1A2O94788 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ALDH1A2O94788 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms