Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TRMUO75648 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMUO75648 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMUO75648 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TRMUO75648 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TRMUO75648 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMUO75648 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMUO75648 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMUO75648 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMUO75648 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMUO75648 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TRMUO75648 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMUO75648 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TRMUO75648 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TRMUO75648 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TRMUO75648 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TRMUO75648 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TRMUO75648 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TRMUO75648 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMUO75648 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMUO75648 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TRMUO75648 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
TRMUO75648 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TRMUO75648 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TRMUO75648 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms