Protein–RNA interactions for Protein: O75603

GCM2, Chorion-specific transcription factor GCMb, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCM2O75603 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCM2O75603 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCM2O75603 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCM2O75603 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCM2O75603 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCM2O75603 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCM2O75603 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCM2O75603 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCM2O75603 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCM2O75603 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCM2O75603 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
GCM2O75603 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCM2O75603 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCM2O75603 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCM2O75603 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCM2O75603 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCM2O75603 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GCM2O75603 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GCM2O75603 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GCM2O75603 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCM2O75603 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCM2O75603 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCM2O75603 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCM2O75603 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCM2O75603 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GCM2O75603 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GCM2O75603 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCM2O75603 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCM2O75603 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCM2O75603 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GCM2O75603 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms