Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
ITGA10O75578 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ITGA10O75578 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms