Protein–RNA interactions for Protein: O75367

H2AFY, Core histone macro-H2A.1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFYO75367 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
H2AFYO75367 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
H2AFYO75367 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
H2AFYO75367 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms