Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PHACTR2O75167 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PHACTR2O75167 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PHACTR2O75167 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms