Protein–RNA interactions for Protein: O60548

FOXD2, Forkhead box protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD2O60548 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FOXD2O60548 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
FOXD2O60548 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
FOXD2O60548 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms