Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC28A2O43868 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC28A2O43868 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A2O43868 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms