Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A20O43772 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC25A20O43772 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms