Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCK2O43639 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NCK2O43639 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NCK2O43639 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NCK2O43639 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCK2O43639 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCK2O43639 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCK2O43639 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NCK2O43639 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NCK2O43639 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NCK2O43639 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCK2O43639 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCK2O43639 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCK2O43639 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCK2O43639 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NCK2O43639 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NCK2O43639 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCK2O43639 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCK2O43639 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCK2O43639 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCK2O43639 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NCK2O43639 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCK2O43639 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCK2O43639 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCK2O43639 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCK2O43639 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCK2O43639 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCK2O43639 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NCK2O43639 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NCK2O43639 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCK2O43639 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCK2O43639 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCK2O43639 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCK2O43639 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NCK2O43639 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCK2O43639 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NCK2O43639 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCK2O43639 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCK2O43639 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCK2O43639 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NCK2O43639 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NCK2O43639 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NCK2O43639 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NCK2O43639 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCK2O43639 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms