Protein–RNA interactions for Protein: O43511

SLC26A4, Pendrin, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A4O43511 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC26A4O43511 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SLC26A4O43511 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SLC26A4O43511 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms