Protein–RNA interactions for Protein: O43283

MAP3K13, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 13, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K13O43283 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MAP3K13O43283 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP3K13O43283 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP3K13O43283 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms