Protein–RNA interactions for Protein: O43252

PAPSS1, Bifunctional 3'-phosphoadenosine 5'-phosphosulfate synthase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPSS1O43252 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAPSS1O43252 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPSS1O43252 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PAPSS1O43252 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms