Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PSMD3O43242 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMD3O43242 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMD3O43242 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms