Protein–RNA interactions for Protein: O15544

LINC01565, Protein GR6, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01565O15544 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LINC01565O15544 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LINC01565O15544 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LINC01565O15544 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms