Protein–RNA interactions for Protein: O15516

CLOCK, Circadian locomoter output cycles protein kaput, humanhuman

Predictions only

Length 846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLOCKO15516 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CLOCKO15516 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.07
CLOCKO15516 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CLOCKO15516 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms