Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
UBDO15205 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
UBDO15205 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
UBDO15205 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
UBDO15205 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBDO15205 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBDO15205 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBDO15205 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBDO15205 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBDO15205 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBDO15205 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
UBDO15205 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
UBDO15205 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
UBDO15205 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
UBDO15205 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBDO15205 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBDO15205 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
UBDO15205 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
UBDO15205 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
UBDO15205 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms