Protein–RNA interactions for Protein: O15111

CHUK, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHUKO15111 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHUKO15111 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHUKO15111 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHUKO15111 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHUKO15111 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHUKO15111 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHUKO15111 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CHUKO15111 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHUKO15111 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHUKO15111 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHUKO15111 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHUKO15111 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHUKO15111 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHUKO15111 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHUKO15111 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHUKO15111 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHUKO15111 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHUKO15111 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHUKO15111 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHUKO15111 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHUKO15111 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHUKO15111 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHUKO15111 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHUKO15111 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CHUKO15111 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHUKO15111 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHUKO15111 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHUKO15111 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHUKO15111 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHUKO15111 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHUKO15111 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHUKO15111 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHUKO15111 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHUKO15111 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHUKO15111 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHUKO15111 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHUKO15111 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHUKO15111 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHUKO15111 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHUKO15111 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms