Protein–RNA interactions for Protein: O14727

APAF1, Apoptotic protease-activating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APAF1O14727 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
APAF1O14727 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
APAF1O14727 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
APAF1O14727 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
APAF1O14727 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
APAF1O14727 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
APAF1O14727 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
APAF1O14727 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
APAF1O14727 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
APAF1O14727 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
APAF1O14727 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
APAF1O14727 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APAF1O14727 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APAF1O14727 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
APAF1O14727 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APAF1O14727 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APAF1O14727 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APAF1O14727 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
APAF1O14727 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APAF1O14727 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
APAF1O14727 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
APAF1O14727 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
APAF1O14727 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APAF1O14727 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APAF1O14727 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
APAF1O14727 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
APAF1O14727 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APAF1O14727 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APAF1O14727 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APAF1O14727 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
APAF1O14727 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APAF1O14727 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
APAF1O14727 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APAF1O14727 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
APAF1O14727 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
APAF1O14727 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
APAF1O14727 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
APAF1O14727 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
APAF1O14727 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
APAF1O14727 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
APAF1O14727 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
APAF1O14727 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
APAF1O14727 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
APAF1O14727 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
APAF1O14727 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
APAF1O14727 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
APAF1O14727 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
APAF1O14727 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
APAF1O14727 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
APAF1O14727 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
APAF1O14727 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
APAF1O14727 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
APAF1O14727 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
APAF1O14727 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
APAF1O14727 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
APAF1O14727 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
APAF1O14727 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
APAF1O14727 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
APAF1O14727 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC30.43■■■□□ 2.46
APAF1O14727 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
APAF1O14727 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
APAF1O14727 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
APAF1O14727 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
APAF1O14727 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
APAF1O14727 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
APAF1O14727 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms