Protein–RNA interactions for Protein: O00574

CXCR6, C-X-C chemokine receptor type 6, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR6O00574 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CXCR6O00574 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CXCR6O00574 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms