Protein–RNA interactions for Protein: O00458

IFRD1, Interferon-related developmental regulator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFRD1O00458 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
IFRD1O00458 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
IFRD1O00458 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
IFRD1O00458 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms