Protein–RNA interactions for Protein: O00408

PDE2A, cGMP-dependent 3',5'-cyclic phosphodiesterase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE2AO00408 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDE2AO00408 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDE2AO00408 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PDE2AO00408 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms