Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NFKBIEO00221 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NFKBIEO00221 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NFKBIEO00221 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms