Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SMAPO00193 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SMAPO00193 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SMAPO00193 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SMAPO00193 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SMAPO00193 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SMAPO00193 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAPO00193 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAPO00193 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAPO00193 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAPO00193 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAPO00193 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAPO00193 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SMAPO00193 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SMAPO00193 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAPO00193 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAPO00193 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAPO00193 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAPO00193 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAPO00193 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SMAPO00193 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SMAPO00193 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAPO00193 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAPO00193 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAPO00193 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAPO00193 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAPO00193 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAPO00193 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SMAPO00193 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms