Protein–RNA interactions for Protein: M5A8F1

ERVH48-1, Suppressyn, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVH48-1M5A8F1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
ERVH48-1M5A8F1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVH48-1M5A8F1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVH48-1M5A8F1 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms