Protein–RNA interactions for Protein: J3QRE1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRE1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
J3QRE1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
J3QRE1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QRE1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QRE1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QRE1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QRE1 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QRE1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QRE1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3QRE1 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3QRE1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3QRE1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QRE1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QRE1 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QRE1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QRE1 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QRE1 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QRE1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QRE1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QRE1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QRE1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QRE1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QRE1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QRE1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QRE1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QRE1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QRE1 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QRE1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QRE1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QRE1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QRE1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QRE1 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QRE1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QRE1 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QRE1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QRE1 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QRE1 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QRE1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QRE1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QRE1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QRE1 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QRE1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QRE1 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QRE1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms