Protein–RNA interactions for Protein: J3QLW9

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QLW9 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QLW9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QLW9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QLW9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
J3QLW9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
J3QLW9 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
J3QLW9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
J3QLW9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
J3QLW9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
J3QLW9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
J3QLW9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
J3QLW9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
J3QLW9 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
J3QLW9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
J3QLW9 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms