Protein–RNA interactions for Protein: I3L3M4

Claudin, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L3M4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
I3L3M4 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
I3L3M4 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
I3L3M4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
I3L3M4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
I3L3M4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
I3L3M4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
I3L3M4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
I3L3M4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
I3L3M4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
I3L3M4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
I3L3M4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
I3L3M4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
I3L3M4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
I3L3M4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
I3L3M4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms