Protein–RNA interactions for Protein: H7C1D1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C1D1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
H7C1D1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
H7C1D1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1D1 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1D1 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
H7C1D1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1D1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1D1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1D1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1D1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1D1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
H7C1D1 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
H7C1D1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C1D1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C1D1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
H7C1D1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
H7C1D1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1D1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1D1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1D1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1D1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
H7C1D1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
H7C1D1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1D1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1D1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1D1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
H7C1D1 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1D1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1D1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1D1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1D1 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1D1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
H7C1D1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
H7C1D1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1D1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1D1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1D1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1D1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1D1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1D1 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
H7C1D1 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1D1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1D1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1D1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1D1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
H7C1D1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1D1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1D1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1D1 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1D1 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1D1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
H7C1D1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
H7C1D1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
H7C1D1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
H7C1D1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
H7C1D1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms